O atual agrupamento, designado de Agrupamento de Escolas Arouca, foi criado por despacho do Secretário de Estado do Ensino e da Administração Escolar, de 28 de junho de 2012, tendo a Comissão Administrativa Provisória (CAP) tomado posse no dia 4 de julho de 2012.
A nova unidade orgânica resulta da agregação do Agrupamento de Escolas de Arouca com a Escola Secundária de Arouca, situando-se a sede na Escola Secundária.