O Colégio Universitário Pio XII é uma instituição criada para os alunos, e sem os quais esta não tem razão de ser. Assim, para além da Direcção do Colégio, responsável, evidentemente, pela administração da instituição, existe um segundo orgão, autónomo, e com poder de decisão: a U.E.C.U.P. XII - União dos estudantes do Colégio Universitário Pio XII