Museus no Centro projeta-se como uma rede de instituições museológicas e patrimoniais de referência ao serviço dos cidadãos, com afirmação da diversidade regional e das figuras identitárias de cada um dos espaços.
Museus no Centro pauta-se pelos Valores da preservação do património, da promoção da cultura, pela competência e pela excelência dos serviços que presta, pela política de acessibilidade e inclusão, pela abertura à comunidade, numa relação estreita e dinâmica com cidadãos e parceiros cumprindo um serviço público.
Museus no Centro tem como Missão o conhecimento, a conservação e a divulgação das diversas coleções e espólio arqueológico que constituem os seus acervos, o desenvolvimento de ações culturais e pedagógicas, tais como visitas comentadas e oficinas pedagógicas, um programa renovado de exposições temporárias, concertos e espetáculos, palestras e cinema.
Os Museus no Centro dispõem de lojas com livros e catálogos, réplicas de peças originais e artigos exclusivos, onde os conceitos de passado e contemporaneidade se cruzam, estando, para breve, o alargamento a todos do serviço de cafetaria, para que a fruição pública destes espaços de cultura e lazer passe a fazer parte dos quotidianos.