A Santa Casa da Misericórdia da Calheta é uma instituição particular de solidariedade social, sem fins lucrativos, fundada em 1931 mas em funções desde 08 de Março de 1932, com a abertura do Hospital de São José na Vila da Calheta que mais tarde passou a ser de gestão pública. Esta instituição teve ainda uma farmácia em 1959 e no ano de 1992 inaugurou o serviço de apoio domiciliário que se mantêm em funcionamento até aos dias de hoje.
Em 2007 a Santa Casa amplia os seus serviços com a abertura da valência do Centro de Actividades Ocupacionais e, por fim, em 2012, entra em funcionamento o tão desejado e necessário Lar de Idosos deste concelho.