O projecto foi da autoria do Arquitecto Aguiar de Guimarães, e o terreno necessário para a obra e para os romeiros foi oferta de Domingos Araújo e sua esposa, D. Maria Amélia, da cidade do Porto.
A inauguração e a bênção do Novo Templo aconteceram em 10 de Julho de 1971, presidida por Dom Francisco Maria da Silva, Arcebispo de Braga.
No dia 21 de Junho de 1999. Dom Eurico Dias Nogueira, Arcebispo de Braga, por decreto próprio elevou as duas Capelas a Santuário de S. Bento das Peras.
No ano de 2003, sofreu uma total remodelação interior. Depois de restaurado, foi reaberto ao culto em 11 de Julho de 2003. Benzeu o novo altar, Dom Jorge Ferreira da Costa Ortiga, Arcebispo de Braga.
A 16 de Julho de 2006 dá-se a inauguração das obras de requalificação do Santuário, que contou com a criação de um posto de vendas, novos sanitários, um novo espaço para a missa campal, novos arruamentos, parque de merendas, parque infantil, parque de estacionamento, áreas ajardinadas e miradouros.